První písemnou zmínku o obci nacházíme v roce 1352, kdy se píše jako Sdoborzicz. Zdebořice byly v minulosti samostatným statkem, který náležel k plánickému panství. Počátkem 17. století Zdebořice získal od Ladislava ze Šternberka Jindřich Koc z Dobrše. Později se ves stala součástí týneckého panství. Zdebořice měly v roce 1902 53 čísel popisných, ve kterých žilo 303 obyvatel. Ve vsi tehdy byla dvoutřídní obecná škola a farní kostel. V roce 1990 zde bylo trvale hlášených 96 lidí a v roce 2004 80 osob.

Pramen: Martin Kříž